En
la zona norte la vegetación natural se encuentra en forma
de bosque siempreverde micrófilo, costero y subcostero sobre
todo en la zona de punta Covarrubias, en la boca de la bahía
de Malagueta.
La flora silvestre ha sido muy afectada por las actividades del
hombre; pero puede encontrarse en los sectores costeros, asociada
a la vegetación de manglar y los bosques semideciduos mesófilos
típicos. Un ejemplo de ello es la Copernicia rigida, que
es localizable al sur de la bahía de Malagueta.
Hacia el centro y este de la región predomina la vegetación
cultural, alternada con pastos, sabanas naturales y vegetación
secundaria. La flora silvestre está vinculada a los restos
de cuabales, con su inventario típico de especies endémicas,
aunque en este caso muy empobrecidos.
El sur, en cuanto a vegetación se refiere se encuentra muy
deforestada, excepto en la franja litoral, cubierta por manglares
espesos. La vegetación seminatural aparece en forma de bosques
semideciduos, mesófilos, con humedad fluctuante. La flora
silvestre está asociada a los manglares y ciénagas
costeras.